DNA侦探工作可能会找到神秘的杀手

美国研究人员表示,来自人类基因组计划的数据可用于鉴定怀疑是许多无法解释的人类疾病背后的细菌和病毒。

团队由波士顿Dana-Farber癌症研究所的MatthewMeyerson领导,将通过消除过程来解决这个问题。他们计划将金彩子彩票app已知的金彩子彩票app人类基因组序列与患病组织样本中所有活性基因的序列进行比较。

一旦从方程式中移除了人类DNA,研究小组就可以调查剩下的是否含有属于特定微生物的DNA-或看起来可能属于未鉴定病毒或细菌的DNA。

健康和患病组织样本的初步测试表明该方法可行。Meyerson希望它可以用来证明微生物是否会引起许多常见的人类疾病,包括冠状动脉疾病,糖尿病,炎症性肠病,多发性硬化症和各种癌症。

“我认为这将成为寻找不明原因疾病原因的首选方法,”Meyerson说。

感染因子Meyerson的研究小组首先从一般组织样本的320多万个“表达序列标签”(ESTs)中“减去”已知的人类基因组序列.EST代表所有打开的基因在一个样本中。

“我们采用了EST并将它们与人类基因组进行了比较,我们发现了一些不匹配的序列。我们的想法是这些序列可能包含导致疾病的传染因子,”Meyerson说。

进一步的研究表明,一些无法比拟的序列确实属于已知的引起疾病的微生物。研究小组表示,一些无法比拟的序列是不可识别的,可能包括目前科学上未知的微生物序列。

DNA过滤器

该团队随后通过检测子宫颈癌细胞的ES金彩子彩票appT来测试他们的微生物发现技术。该技术“过滤”了人类和其他DNA,以揭示与已知导致宫颈癌的病毒相匹配的序列。

Meyerson说,如果该团队还不知道该病毒与宫颈癌有关,该技术可能会将其作为进一步调查的主要候选人。

Meyerson的实验室现在正在创建各种病变组织的EST库。“我们的目标是利用这种方法寻找新的生物体,”他说。但可能需要一些时间,他承认。

该过程的“序列减法”部分可以在短短一周内完成。但是使用一系列神秘DNA鉴定一种新的致病生物可能需要数周到数年的时间,他说。

期刊参考和结肠;自然遗传学

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